特定の線や文字だけカットできますか？

Graphtec Pro Studio画面上でカットしたい部分のオブジェクトを選択し、「カット・プロット」で下記「選択範囲のみ」をクリックすると選択されたオブジェクトのみカットされます。

また、下記例のようにオブジェクトのカラーを変えて作成しておくことで、「カット・プロット」の中の「ドライバオプション」で選択色のみカット指定が可能です。
“描画カラー”に作製したオブジェクトのカラーが表示されますので、“描画カラー”のカットマークをクリックするとの表示になりカットしなくなります。