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NTPと同期する間隔は任意でしょうか。手動で同期(例えば、測定する前に手動で同期等)も可能でしょうか。

同期の間隔は以下となり、手動での同期は行えません。
直ちに同期:同期時刻が来ると、すぐに時計サーバーの時刻に合わせます。
徐々に同期:同期時刻が来ても、すぐに同期はしません。徐々に時計サーバーの時刻に同期させていきます。(調整量は約43秒/日)