本体でCH間での演算は可能ですか？

CH 間演算設定は可能です。CH 間演算は、測定用チャネルとは別に、専用チャネル（20チャネル分あり）実施可能です。
「AMP」メニューの「アンプ設定」にてCALCを選択し、任意の演算チャネルにて演算式を設定してください。