SD1へ収録をしながら、過去にSD1へ記録したデータをSD2にコピーすることは可能でしょうか。

推奨としてはバックアップ機能を使用して頂ければ可能です。
収録中にファイルメニューからコピーすることも可能とは思いますが、収録動作に与える影響が予期できないためお勧めいたしません。
バックアップでしたらロガー側でタイミングなど管理した上で行うため安全です。