インターネット上のNTPサーバーではなく、ローカルネットワーク内のPCで時刻同期をとる事はできますか？

ご利用PCにてNTPサーバが動作するように設定されていれば、GL側の時刻サーバ設定部にPCのIPアドレスを設定する事で対応可能となります。
なお時計合わせの場合、データのトリガ時刻はある程度同期しますが、データそのもののサンプリングクロックは時計とは別ですのでデータ個々のタイムスタンプは個々の機体でズレが生じます。